Najbardziej skutecznym sposobem ochrony plantacji rzepaku przed chwastami jest stosowanie herbicydów. Warunkiem uzyskania oczekiwanych efektów jest dobór środka chemicznego odpowiednio do struktury zachwaszczenia plantacji oraz terminowe wykonanie zabiegu.
W uprawach rzepaku ozimego możemy stosować herbicydy doglebowe przed wschodami rzepaku (przed siewem lub po siewie) albo dolistne jesienią po wschodach chwastów i rzepaku. Pamiętać należy, że preparaty doglebowe działają skutecznie tylko w środowisku wilgotnym. Zabieg wykonany na gleby przesuszone, z każdym dniem traci na swym efektywnym działaniu a substancja aktywna bardzo wolno ulega rozkładowi.
Zwalczanie chwastów w okresie od założenia plantacji do końca wegetacji jesienią jest o tyle istotne, że rzepak jest w tym okresie najbardziej wrażliwy na konkurencyjne oddziaływanie chwastów, a niezwalczone chwasty mogą być powodem gorszego przezimowania rzepaku z uwagi na słabszą kondycję rzepaku rosnącego w takich warunkach oraz możliwość zbyt wysokiego wyniesienia stożka wzrostu ponad powierzchnię gleby z powodu zacieniania roślin przez chwasty.
Jeżeli nie zastosowano herbicydów jesienią – to można wykonać zabieg wiosną, jednakże skuteczność takiego zabiegu w stosunku do chwastów, które skiełkowały już jesienią może być niedostateczna z powodu mniejszej wrażliwości na herbicydy – chwasty są wtedy w starszych fazach rozwojowych.